“解説記事”
オミクロンの多数の変異は、免疫系が弱っている人が長期間にわたって感染した場合、あるいはウイルスがヒトから動物種に移行し、再び戻った場合に蓄積したのではないかと推測している。これらの変異の影響を評価するため、研究者たちは、疑似ウイルスと呼ばれる複製不能なウイルスを操作して、コロナウイルスと同じように表面にスパイクタンパク質を生成させた。そして、オミクロンの変異と、パンデミックで確認された初期の変異体に見られる変異を持つスパイクタンパク質を持つ偽ウイルスを作成した。まず、異なるバージョンのスパイクタンパク質が、ウイルスが細胞内に侵入する際に用いる細胞表面のタンパク質と、どの程度結合できるかを調べた。このタンパク質は、アンジオテンシン変換酵素2（ACE2）受容体と呼ばれるものである。オミクロンバージョンがマウスのACE2レセプターに効率的に結合できることを発見し、オミクロンはヒトと他の哺乳類の間で「ピンポン」できるかもしれないと示唆している。、以前のウイルスに対する抗体が、オミクロン変異体に対してどの程度の防御効果を示すかを調べた。これは、以前に以前のバージョンのウイルスに感染した患者、以前のウイルス株に対してワクチンを接種した患者、あるいは感染した後にワクチンを接種した患者の抗体を用いて行ったものである。その結果、初期のウイルス株に感染したことのある患者と、現在最も使用されている6種類のワクチンのいずれかを接種した患者の抗体は、いずれも感染を阻止する能力が低下していることが判明した。過去に感染した人、スプートニクVまたはシノファームのワクチンを接種した人、ジョンソン・エンド・ジョンソンのワクチンを1回接種した人の抗体は、オミクロン変異体の細胞への侵入を阻止する能力（「中和」能力）をほとんど、あるいは全く持っていなかった。モデルナ、ファイザー、バイオテック、アストラゼネカのワクチンを2回接種した人の抗体は、20〜40倍に減少したとはいえ、中和活性を保持しており、他の変異体よりはるかに優れていた。感染して回復し、その後ワクチンを2回接種した人の抗体も活性が低下していたが、その低下幅は約5倍と小さく、感染後のワクチン接種が有用であることが明らかになった。腎臓透析患者のグループでは、ModernaとPfizer/BioNTechが製造したmRNAワクチンの3回目の接種を受けた人の抗体では、中和活性が4倍しか低下していなかった。「これは、3回目の投与がオミクロンに対して本当に、本当に有効であることを示しています」とVeesler
Broadly neutralizing antibodies overcome SARS-CoV-2 Omicron antigenic shift
https://www.nature.com/articles/d41586-021-03825-4
国際科学者チームは、OmicronをはじめとするSARS-CoV-2亜種を中和する抗体を同定しました。これらの抗体は、ウイルスのスパイクタンパク質のうち、ウイルスが変異しても基本的に変化しない部分を標的としている。
最近出現したSARS-CoV-2 Omicron変異体は、スパイク（S）タンパク質に37個のアミノ酸置換があり、そのうち15個は受容体結合ドメイン（RBD）であるため、利用できるワクチンや抗体医薬の有効性が懸念されている。今回、オミクロンのRBDがWuhan-Hu-1のRBDよりも高い親和性でヒトACE2に結合し、マウスのACE2にも結合することを明らかにした。Omicronに対する血漿中和活性は、回復期およびワクチン接種者において、祖先の偽ウイルス(ancestral pseudovirus)と比較して顕著な低下が観察されたが、3回目のワクチン接種後によりこの低下は縮小した。
receptor-binding motif (RBM):受容体結合モチーフ（RBM-directed モノクローナル抗体（mAb）のほとんどは、in vitroではOmicronに対する中和活性を失い、29のmAbのうち、ACE2模倣のS2K146 mAb1を含む3つだけが効力を維持した。さらに、広範な中和能を持つsarbecovirus mAbsのうち、ソトロビマブ2、S2X2593、S2H974など、RBM外の抗原部位を認識することでオミクロンを中和するものがあった。オミクロンを介した免疫回避:immune evasionの大きさは、SARS-CoV-2 antigenic shiftを示すものである。SARS-CoV-2変異体や他のsarbecovirusに保存されているRBDエピトープを認識する広範な中和mAbsは、現在進行中のパンデミックと将来の動物由来感染拡大の抑制に重要であることが証明されるかもしれない。
